Директор - д-р Ментор Зеќири
Сектор за заштита на растенија
- Одделение за заштита на растенијата и прогноза на болести и штетници
- Одделение за регионални центри - лаборатории
Сектор за агрохемија
- Одделение за производи за заштита на растенијата
- Одделение за ѓубрива
Сектор за фитосанитарна регулатива и менаџмент